Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIPA1Q96FS4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms