Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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H2-M10.4Q85ZW8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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H2-M10.4Q85ZW8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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H2-M10.4Q85ZW8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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