Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Zbed4Q80WQ9 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Zbed4Q80WQ9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Zbed4Q80WQ9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Zbed4Q80WQ9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Zbed4Q80WQ9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Zbed4Q80WQ9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Zbed4Q80WQ9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Zbed4Q80WQ9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Zbed4Q80WQ9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Zbed4Q80WQ9 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Zbed4Q80WQ9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Zbed4Q80WQ9 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbed4Q80WQ9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms