Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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