Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atg9bQ6EBV9 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atg9bQ6EBV9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atg9bQ6EBV9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atg9bQ6EBV9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atg9bQ6EBV9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atg9bQ6EBV9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Atg9bQ6EBV9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Atg9bQ6EBV9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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