Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Utp15-201ENSMUST00000040972 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Cemip-201ENSMUST00000064174 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
D130052B06RikQ3UW13 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms