Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Neurl1bQ0MW30 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms