Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms