Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms