Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms