Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp4P35123 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms