Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxrgP28705 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms