Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myo5bP21271 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms