Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NelfeP19426 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NelfeP19426 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NelfeP19426 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms