Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms