Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gfi1bO70237 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gfi1bO70237 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1bO70237 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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