Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Zfp870J3QMA4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp870J3QMA4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp870J3QMA4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp870J3QMA4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Zfp870J3QMA4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Zfp870J3QMA4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Zfp870J3QMA4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Zfp870J3QMA4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp870J3QMA4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp870J3QMA4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Zfp870J3QMA4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp870J3QMA4 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp870J3QMA4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp870J3QMA4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Zfp870J3QMA4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Zfp870J3QMA4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Zfp870J3QMA4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Zfp870J3QMA4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Zfp870J3QMA4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Zfp870J3QMA4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp870J3QMA4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp870J3QMA4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp870J3QMA4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Zfp870J3QMA4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Zfp870J3QMA4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Zfp870J3QMA4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp870J3QMA4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp870J3QMA4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp870J3QMA4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp870J3QMA4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp870J3QMA4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp870J3QMA4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp870J3QMA4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp870J3QMA4 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp870J3QMA4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp870J3QMA4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp870J3QMA4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp870J3QMA4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp870J3QMA4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp870J3QMA4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp870J3QMA4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp870J3QMA4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp870J3QMA4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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