Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rnf148G3X9R7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms