Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cldn13Q9Z0S4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn13Q9Z0S4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms