Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms