Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx6Q9ER75 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms