Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms