Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlgn1Q99K10 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms