Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trim68Q8K243 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trim68Q8K243 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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