Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmod1Q8BVA4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmod1Q8BVA4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms