Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ83

Tm2d3, TM2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d3Q8BJ83 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d3Q8BJ83 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms