Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Liat1Q810M6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Liat1Q810M6 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms