Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp8Q80YR6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms