Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms