Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Trim28Q62318 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Trim28Q62318 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms