Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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PtprnQ60673 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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PtprnQ60673 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
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PtprnQ60673 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprnQ60673 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprnQ60673 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprnQ60673 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprnQ60673 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprnQ60673 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprnQ60673 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms