Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms