Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc9Q3V038 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms