Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
D130052B06RikQ3UW13 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms