Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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