Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U595 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U595 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U595 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U595 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U595 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U595 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U595 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U595 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U595 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U595 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U595 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U595 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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