Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arhgap9Q1HDU4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms