Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc39dQ0VF76 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms