Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms