Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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