Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpardP35396 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpardP35396 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpardP35396 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpardP35396 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpardP35396 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpardP35396 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpardP35396 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpardP35396 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpardP35396 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpardP35396 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpardP35396 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpardP35396 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpardP35396 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpardP35396 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpardP35396 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpardP35396 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpardP35396 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms