Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dusp1P28563 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms