Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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