Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POP4O95707 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POP4O95707 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms