Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ccl20O89093 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ccl20O89093 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl20O89093 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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