Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Col5a1O88207 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Col5a1O88207 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Col5a1O88207 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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