Protein–RNA interactions for Protein: O55038

Cxcl13, C-X-C motif chemokine 13, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl13O55038 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Cxcl13O55038 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcl13O55038 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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