Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms