Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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GIN1Q9NXP7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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