Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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OtofQ9ESF1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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OtofQ9ESF1 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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OtofQ9ESF1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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OtofQ9ESF1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
OtofQ9ESF1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms